Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL1Q00532 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKL1Q00532 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKL1Q00532 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKL1Q00532 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms