Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED6P86452 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED6P86452 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED6P86452 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms