Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS25P82663 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS25P82663 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPS25P82663 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms