Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CRB1P82279 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CRB1P82279 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CRB1P82279 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CRB1P82279 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CRB1P82279 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CRB1P82279 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CRB1P82279 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CRB1P82279 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CRB1P82279 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CRB1P82279 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CRB1P82279 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CRB1P82279 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CRB1P82279 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CRB1P82279 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
CRB1P82279 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CRB1P82279 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CRB1P82279 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CRB1P82279 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CRB1P82279 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CRB1P82279 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CRB1P82279 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CRB1P82279 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CRB1P82279 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CRB1P82279 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CRB1P82279 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CRB1P82279 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CRB1P82279 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CRB1P82279 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CRB1P82279 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CRB1P82279 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CRB1P82279 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CRB1P82279 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CRB1P82279 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CRB1P82279 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CRB1P82279 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CRB1P82279 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CRB1P82279 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CRB1P82279 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CRB1P82279 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CRB1P82279 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CRB1P82279 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CRB1P82279 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CRB1P82279 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CRB1P82279 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CRB1P82279 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CRB1P82279 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CRB1P82279 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CRB1P82279 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CRB1P82279 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRB1P82279 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CRB1P82279 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CRB1P82279 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CRB1P82279 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CRB1P82279 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CRB1P82279 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CRB1P82279 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CRB1P82279 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CRB1P82279 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CRB1P82279 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CRB1P82279 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CRB1P82279 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CRB1P82279 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CRB1P82279 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CRB1P82279 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CRB1P82279 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CRB1P82279 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CRB1P82279 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CRB1P82279 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CRB1P82279 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CRB1P82279 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CRB1P82279 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CRB1P82279 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CRB1P82279 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CRB1P82279 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CRB1P82279 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CRB1P82279 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CRB1P82279 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CRB1P82279 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CRB1P82279 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CRB1P82279 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CRB1P82279 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CRB1P82279 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CRB1P82279 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CRB1P82279 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CRB1P82279 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CRB1P82279 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CRB1P82279 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CRB1P82279 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CRB1P82279 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CRB1P82279 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms