Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAE1P78406 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAE1P78406 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAE1P78406 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAE1P78406 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAE1P78406 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAE1P78406 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAE1P78406 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAE1P78406 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAE1P78406 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAE1P78406 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAE1P78406 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAE1P78406 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAE1P78406 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAE1P78406 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAE1P78406 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAE1P78406 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAE1P78406 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAE1P78406 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAE1P78406 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAE1P78406 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAE1P78406 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAE1P78406 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAE1P78406 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAE1P78406 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAE1P78406 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAE1P78406 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAE1P78406 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAE1P78406 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAE1P78406 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAE1P78406 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAE1P78406 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAE1P78406 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAE1P78406 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAE1P78406 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAE1P78406 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAE1P78406 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAE1P78406 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAE1P78406 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAE1P78406 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAE1P78406 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAE1P78406 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAE1P78406 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAE1P78406 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAE1P78406 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAE1P78406 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAE1P78406 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAE1P78406 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAE1P78406 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAE1P78406 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAE1P78406 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAE1P78406 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAE1P78406 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAE1P78406 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAE1P78406 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAE1P78406 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAE1P78406 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAE1P78406 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAE1P78406 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAE1P78406 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms