Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRAMEP78395 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEP78395 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEP78395 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEP78395 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms