Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT85P78386 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT85P78386 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT85P78386 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT85P78386 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT85P78386 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT85P78386 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT85P78386 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT85P78386 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT85P78386 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT85P78386 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT85P78386 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT85P78386 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT85P78386 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT85P78386 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT85P78386 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT85P78386 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT85P78386 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT85P78386 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT85P78386 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT85P78386 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT85P78386 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT85P78386 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT85P78386 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT85P78386 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT85P78386 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT85P78386 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT85P78386 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT85P78386 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT85P78386 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT85P78386 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT85P78386 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT85P78386 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT85P78386 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT85P78386 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT85P78386 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT85P78386 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT85P78386 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT85P78386 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT85P78386 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT85P78386 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT85P78386 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT85P78386 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT85P78386 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT85P78386 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT85P78386 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT85P78386 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT85P78386 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT85P78386 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT85P78386 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT85P78386 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT85P78386 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT85P78386 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT85P78386 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT85P78386 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT85P78386 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT85P78386 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT85P78386 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT85P78386 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT85P78386 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT85P78386 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT85P78386 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT85P78386 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT85P78386 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT85P78386 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT85P78386 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT85P78386 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT85P78386 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT85P78386 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT85P78386 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT85P78386 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT85P78386 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT85P78386 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT85P78386 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT85P78386 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT85P78386 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT85P78386 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT85P78386 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT85P78386 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT85P78386 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT85P78386 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT85P78386 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT85P78386 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT85P78386 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT85P78386 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT85P78386 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT85P78386 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT85P78386 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT85P78386 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT85P78386 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT85P78386 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT85P78386 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT85P78386 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT85P78386 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT85P78386 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT85P78386 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KRT85P78386 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT85P78386 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT85P78386 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT85P78386 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms