Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2P78314 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3BP2P78314 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2P78314 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms