Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERV-K104P61576 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERV-K104P61576 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms