Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P61574 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms