Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1BP61266 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1BP61266 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1BP61266 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX1BP61266 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1BP61266 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1BP61266 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1BP61266 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX1BP61266 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1BP61266 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1BP61266 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1BP61266 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1BP61266 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1BP61266 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX1BP61266 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX1BP61266 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1BP61266 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1BP61266 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1BP61266 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1BP61266 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1BP61266 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1BP61266 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1BP61266 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1BP61266 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1BP61266 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1BP61266 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1BP61266 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1BP61266 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1BP61266 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX1BP61266 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX1BP61266 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX1BP61266 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1BP61266 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1BP61266 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1BP61266 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1BP61266 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1BP61266 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1BP61266 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1BP61266 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1BP61266 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1BP61266 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1BP61266 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1BP61266 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1BP61266 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1BP61266 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1BP61266 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1BP61266 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1BP61266 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1BP61266 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1BP61266 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1BP61266 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1BP61266 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1BP61266 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX1BP61266 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1BP61266 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1BP61266 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1BP61266 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1BP61266 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1BP61266 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1BP61266 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX1BP61266 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1BP61266 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1BP61266 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX1BP61266 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STX1BP61266 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
STX1BP61266 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1BP61266 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1BP61266 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1BP61266 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1BP61266 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1BP61266 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1BP61266 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1BP61266 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX1BP61266 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1BP61266 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1BP61266 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1BP61266 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1BP61266 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1BP61266 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1BP61266 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX1BP61266 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms