Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTXN1P60606 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTXN1P60606 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms