Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTENP60484 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTENP60484 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTENP60484 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTENP60484 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTENP60484 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTENP60484 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTENP60484 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTENP60484 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTENP60484 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTENP60484 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTENP60484 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTENP60484 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTENP60484 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTENP60484 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTENP60484 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTENP60484 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTENP60484 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTENP60484 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTENP60484 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTENP60484 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTENP60484 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTENP60484 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTENP60484 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTENP60484 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTENP60484 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTENP60484 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTENP60484 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTENP60484 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTENP60484 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTENP60484 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTENP60484 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTENP60484 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTENP60484 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTENP60484 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTENP60484 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTENP60484 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTENP60484 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTENP60484 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTENP60484 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTENP60484 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTENP60484 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTENP60484 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTENP60484 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTENP60484 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTENP60484 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTENP60484 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTENP60484 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTENP60484 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTENP60484 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTENP60484 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTENP60484 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTENP60484 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTENP60484 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTENP60484 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTENP60484 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTENP60484 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTENP60484 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTENP60484 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTENP60484 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTENP60484 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTENP60484 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTENP60484 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTENP60484 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTENP60484 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTENP60484 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTENP60484 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTENP60484 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTENP60484 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTENP60484 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTENP60484 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTENP60484 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTENP60484 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms