Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01547P58512 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01547P58512 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01547P58512 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01547P58512 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01547P58512 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01547P58512 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01547P58512 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01547P58512 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01547P58512 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01547P58512 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01547P58512 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01547P58512 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01547P58512 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01547P58512 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01547P58512 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01547P58512 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01547P58512 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01547P58512 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01547P58512 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms