Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC13P55735 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC13P55735 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC13P55735 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC13P55735 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC13P55735 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC13P55735 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC13P55735 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC13P55735 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC13P55735 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC13P55735 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC13P55735 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC13P55735 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC13P55735 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC13P55735 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC13P55735 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC13P55735 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC13P55735 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC13P55735 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC13P55735 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC13P55735 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC13P55735 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC13P55735 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC13P55735 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC13P55735 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC13P55735 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC13P55735 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC13P55735 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC13P55735 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC13P55735 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC13P55735 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC13P55735 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC13P55735 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEC13P55735 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC13P55735 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC13P55735 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC13P55735 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC13P55735 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC13P55735 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC13P55735 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC13P55735 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC13P55735 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC13P55735 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC13P55735 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC13P55735 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC13P55735 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC13P55735 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC13P55735 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC13P55735 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC13P55735 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC13P55735 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC13P55735 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC13P55735 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC13P55735 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC13P55735 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC13P55735 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC13P55735 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC13P55735 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC13P55735 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC13P55735 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC13P55735 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC13P55735 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC13P55735 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC13P55735 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC13P55735 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC13P55735 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC13P55735 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC13P55735 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC13P55735 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC13P55735 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC13P55735 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC13P55735 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC13P55735 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC13P55735 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC13P55735 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC13P55735 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC13P55735 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC13P55735 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC13P55735 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC13P55735 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC13P55735 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC13P55735 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC13P55735 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC13P55735 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC13P55735 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC13P55735 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC13P55735 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC13P55735 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC13P55735 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC13P55735 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC13P55735 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC13P55735 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC13P55735 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC13P55735 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC13P55735 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC13P55735 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC13P55735 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC13P55735 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC13P55735 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC13P55735 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms