Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH6P55285 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH6P55285 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH6P55285 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH6P55285 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH6P55285 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH6P55285 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH6P55285 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH6P55285 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH6P55285 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH6P55285 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH6P55285 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH6P55285 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH6P55285 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH6P55285 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH6P55285 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH6P55285 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH6P55285 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH6P55285 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH6P55285 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH6P55285 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH6P55285 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH6P55285 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH6P55285 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH6P55285 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH6P55285 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH6P55285 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH6P55285 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH6P55285 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH6P55285 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH6P55285 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH6P55285 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH6P55285 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH6P55285 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH6P55285 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH6P55285 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH6P55285 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH6P55285 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH6P55285 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH6P55285 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH6P55285 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH6P55285 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH6P55285 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH6P55285 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH6P55285 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH6P55285 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH6P55285 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH6P55285 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH6P55285 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH6P55285 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH6P55285 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH6P55285 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH6P55285 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH6P55285 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH6P55285 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH6P55285 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH6P55285 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH6P55285 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH6P55285 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH6P55285 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH6P55285 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH6P55285 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH6P55285 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH6P55285 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH6P55285 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH6P55285 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH6P55285 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH6P55285 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH6P55285 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH6P55285 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH6P55285 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH6P55285 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH6P55285 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH6P55285 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH6P55285 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH6P55285 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH6P55285 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH6P55285 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH6P55285 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH6P55285 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH6P55285 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 950 ms