Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2DP55273 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2DP55273 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN2DP55273 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms