Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTTPP55157 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTTPP55157 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTTPP55157 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTTPP55157 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MTTPP55157 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MTTPP55157 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTTPP55157 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTTPP55157 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTTPP55157 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTTPP55157 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTTPP55157 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTTPP55157 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTTPP55157 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTTPP55157 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTTPP55157 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTTPP55157 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTTPP55157 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTTPP55157 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTTPP55157 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MTTPP55157 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTTPP55157 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTTPP55157 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTTPP55157 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTTPP55157 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTTPP55157 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTTPP55157 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTTPP55157 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTTPP55157 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTTPP55157 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTTPP55157 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTTPP55157 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTTPP55157 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTTPP55157 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTTPP55157 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTTPP55157 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTTPP55157 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTTPP55157 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTTPP55157 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTTPP55157 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTTPP55157 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTTPP55157 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTTPP55157 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTTPP55157 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTTPP55157 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MTTPP55157 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTTPP55157 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTTPP55157 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTTPP55157 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTTPP55157 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTTPP55157 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTTPP55157 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTTPP55157 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTTPP55157 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTTPP55157 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTTPP55157 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTTPP55157 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTTPP55157 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTTPP55157 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTTPP55157 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTTPP55157 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTTPP55157 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTTPP55157 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTTPP55157 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTTPP55157 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTTPP55157 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTTPP55157 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTTPP55157 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTTPP55157 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTTPP55157 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTTPP55157 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTTPP55157 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTTPP55157 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTTPP55157 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTTPP55157 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTTPP55157 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTTPP55157 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTTPP55157 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTTPP55157 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTTPP55157 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTTPP55157 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTTPP55157 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTTPP55157 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTTPP55157 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTTPP55157 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTTPP55157 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTTPP55157 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTTPP55157 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTTPP55157 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTTPP55157 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTTPP55157 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTTPP55157 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTTPP55157 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTTPP55157 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTTPP55157 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTTPP55157 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTTPP55157 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTTPP55157 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms