Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA4P54764 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA4P54764 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA4P54764 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA4P54764 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms