Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24CP53992 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24CP53992 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms