Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKX2-5P52952 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NKX2-5P52952 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms