Protein–RNA interactions for Protein: P51817

PRKX, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit PRKX, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKXP51817 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKXP51817 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKXP51817 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKXP51817 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKXP51817 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKXP51817 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKXP51817 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKXP51817 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKXP51817 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKXP51817 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKXP51817 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKXP51817 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKXP51817 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKXP51817 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKXP51817 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKXP51817 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKXP51817 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKXP51817 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKXP51817 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKXP51817 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKXP51817 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKXP51817 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKXP51817 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKXP51817 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKXP51817 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKXP51817 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKXP51817 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKXP51817 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKXP51817 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKXP51817 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKXP51817 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKXP51817 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKXP51817 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKXP51817 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKXP51817 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKXP51817 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKXP51817 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKXP51817 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKXP51817 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKXP51817 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKXP51817 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKXP51817 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKXP51817 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKXP51817 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKXP51817 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKXP51817 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKXP51817 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKXP51817 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKXP51817 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKXP51817 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKXP51817 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKXP51817 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKXP51817 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKXP51817 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKXP51817 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKXP51817 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKXP51817 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKXP51817 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKXP51817 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKXP51817 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKXP51817 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKXP51817 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKXP51817 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKXP51817 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKXP51817 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKXP51817 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKXP51817 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKXP51817 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKXP51817 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKXP51817 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKXP51817 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKXP51817 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKXP51817 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKXP51817 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKXP51817 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKXP51817 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKXP51817 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKXP51817 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms