Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IDH3AP50213 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IDH3AP50213 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3AP50213 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3AP50213 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms