Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK1P49759 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK1P49759 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK1P49759 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK1P49759 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK1P49759 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK1P49759 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK1P49759 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK1P49759 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK1P49759 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLK1P49759 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLK1P49759 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK1P49759 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK1P49759 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK1P49759 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK1P49759 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK1P49759 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK1P49759 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK1P49759 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK1P49759 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK1P49759 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK1P49759 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK1P49759 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK1P49759 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK1P49759 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK1P49759 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK1P49759 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK1P49759 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK1P49759 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK1P49759 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK1P49759 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK1P49759 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK1P49759 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK1P49759 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK1P49759 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK1P49759 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK1P49759 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK1P49759 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK1P49759 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK1P49759 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK1P49759 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK1P49759 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK1P49759 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK1P49759 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK1P49759 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK1P49759 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLK1P49759 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLK1P49759 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CLK1P49759 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK1P49759 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK1P49759 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK1P49759 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK1P49759 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK1P49759 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK1P49759 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK1P49759 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK1P49759 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK1P49759 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK1P49759 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK1P49759 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK1P49759 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK1P49759 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK1P49759 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK1P49759 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK1P49759 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK1P49759 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK1P49759 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK1P49759 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK1P49759 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK1P49759 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK1P49759 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK1P49759 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK1P49759 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK1P49759 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK1P49759 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK1P49759 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK1P49759 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK1P49759 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK1P49759 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK1P49759 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms