Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GLG1-210ENST00000565474 601 ntTSL 45.43□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CHCHD3-205ENST00000481152 1367 ntTSL 25.42□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDC14A-204ENST00000455467 841 ntTSL 35.34□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DDX10-207ENST00000534439 438 ntTSL 55.17□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-215ENST00000521557 601 ntTSL 45.17□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZNF283-202ENST00000586976 590 ntTSL 54.97□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-216ENST00000522150 573 ntTSL 54.84□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-220ENST00000523925 529 ntTSL 34.81□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-212ENST00000529782 561 ntTSL 44.78□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 UQCRH-204ENST00000489056 553 ntTSL 24.76□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CHD9-201ENST00000219084 8739 ntTSL 1 (best)4.67□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-212ENST00000443315 580 ntTSL 44.66□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ITFG1-203ENST00000542691 1464 ntTSL 24.52□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-221ENST00000630833 567 ntTSL 44.47□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-204ENST00000525438 577 ntTSL 44.26□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NF1-206ENST00000466819 1177 ntTSL 54.06□□□□□ -1.769e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 IFT46-212ENST00000534156 776 ntTSL 54.04□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIAA1328-208ENST00000591911 496 ntTSL 53.86□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-214ENST00000577363 282 ntTSL 53.78□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-216ENST00000491623 582 ntTSL 53.74□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-221ENST00000523964 567 ntTSL 43.71□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-209ENST00000527782 490 ntTSL 43.71□□□□□ -1.823e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-203ENST00000524497 555 ntTSL 53.53□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CHD9-216ENST00000565803 3625 ntTSL 53.21□□□□□ -1.93e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-214ENST00000521484 556 ntTSL 43.11□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ITFG1-208ENST00000565262 584 ntTSL 33.05□□□□□ -1.923e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-210ENST00000503773 3031 ntTSL 53.02□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CHD9-209ENST00000564255 2896 ntTSL 52.97□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-210ENST00000519636 575 ntTSL 52.97□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.943e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.943e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-210ENST00000528893 457 ntTSL 32.57□□□□□ -23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-232ENST00000637544 214 ntTSL 52.5□□□□□ -2.013e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-217ENST00000522482 576 ntTSL 42.34□□□□□ -2.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 32.23□□□□□ -2.053e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.13e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.273e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.373e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-229ENST00000636912 100 ntTSL 5-0.1□□□□□ -2.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 61.6
AARSP49588 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 61.6
AARSP49588 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 61.6
AARSP49588 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 61.6
AARSP49588 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 61.6
AARSP49588 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 61.6
AARSP49588 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 512.53□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 61.3
AARSP49588 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 511.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 61.3
AARSP49588 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 61.3
AARSP49588 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-10■■■■■ 61.3
AARSP49588 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.589e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.589e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.479e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-211ENST00000531065 1548 ntTSL 529.56■■■□□ 2.329e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.199e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.169e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-206ENST00000527302 719 ntTSL 327.95■■■□□ 2.069e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-207ENST00000527826 837 ntTSL 1 (best)27.86■■■□□ 2.059e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-205ENST00000527109 1030 ntTSL 1 (best)27.86■■■□□ 2.059e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.059e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.029e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.969e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-208ENST00000527871 1243 ntTSL 1 (best)26.52■■□□□ 1.849e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-215ENST00000533872 1114 ntTSL 526.51■■□□□ 1.839e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.819e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-213ENST00000533161 1186 ntTSL 1 (best)25.93■■□□□ 1.749e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 GGA1-212ENST00000439161 568 ntTSL 425.59■■□□□ 1.699e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ENTPD5-203ENST00000554664 1119 ntTSL 324.34■■□□□ 1.499e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 TEPSIN-202ENST00000570854 849 ntTSL 324.05■■□□□ 1.449e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.319e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.39e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.299e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.299e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 322.92■■□□□ 1.269e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.269e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ARL6IP6-205ENST00000495469 1308 ntTSL 222.75■■□□□ 1.239e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 RPS2-204ENST00000526908 638 ntTSL 222.17■■□□□ 1.149e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.149e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 ABCF2-203ENST00000441774 941 ntTSL 322.03■■□□□ 1.129e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 PALM-210ENST00000593172 2489 ntTSL 221.96■■□□□ 1.119e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.099e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 PALM-211ENST00000633534 879 ntTSL 321.23■□□□□ 0.999e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 LZTS2-207ENST00000489526 802 ntTSL 221.15■□□□□ 0.989e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.919e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.899e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 520.57■□□□□ 0.889e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 220.51■□□□□ 0.879e-7■■■■■ 61.1
AARSP49588 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.869e-7■■■■■ 61.1
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