Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM4P49221 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM4P49221 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM4P49221 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM4P49221 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM4P49221 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM4P49221 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGM4P49221 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM4P49221 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM4P49221 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGM4P49221 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGM4P49221 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM4P49221 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM4P49221 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM4P49221 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM4P49221 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM4P49221 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGM4P49221 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM4P49221 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM4P49221 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM4P49221 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM4P49221 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM4P49221 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM4P49221 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM4P49221 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGM4P49221 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGM4P49221 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGM4P49221 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM4P49221 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM4P49221 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM4P49221 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM4P49221 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM4P49221 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM4P49221 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM4P49221 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM4P49221 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM4P49221 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM4P49221 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM4P49221 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM4P49221 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM4P49221 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM4P49221 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM4P49221 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM4P49221 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM4P49221 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM4P49221 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM4P49221 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM4P49221 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM4P49221 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM4P49221 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM4P49221 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM4P49221 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM4P49221 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM4P49221 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM4P49221 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM4P49221 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM4P49221 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM4P49221 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM4P49221 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGM4P49221 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGM4P49221 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGM4P49221 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM4P49221 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM4P49221 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM4P49221 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM4P49221 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM4P49221 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM4P49221 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM4P49221 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms