Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMUP48645 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMUP48645 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMUP48645 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMUP48645 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMUP48645 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMUP48645 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMUP48645 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMUP48645 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMUP48645 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMUP48645 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMUP48645 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMUP48645 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMUP48645 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMUP48645 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMUP48645 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMUP48645 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMUP48645 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMUP48645 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMUP48645 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMUP48645 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMUP48645 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMUP48645 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMUP48645 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMUP48645 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMUP48645 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMUP48645 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMUP48645 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMUP48645 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMUP48645 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMUP48645 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMUP48645 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMUP48645 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMUP48645 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NMUP48645 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMUP48645 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMUP48645 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMUP48645 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMUP48645 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMUP48645 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMUP48645 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMUP48645 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMUP48645 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMUP48645 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMUP48645 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMUP48645 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMUP48645 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMUP48645 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMUP48645 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMUP48645 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMUP48645 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMUP48645 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NMUP48645 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NMUP48645 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NMUP48645 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms