Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XCR1P46094 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XCR1P46094 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XCR1P46094 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XCR1P46094 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XCR1P46094 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XCR1P46094 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XCR1P46094 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XCR1P46094 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XCR1P46094 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XCR1P46094 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XCR1P46094 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XCR1P46094 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XCR1P46094 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XCR1P46094 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XCR1P46094 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XCR1P46094 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XCR1P46094 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XCR1P46094 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XCR1P46094 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XCR1P46094 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XCR1P46094 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XCR1P46094 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XCR1P46094 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XCR1P46094 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XCR1P46094 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XCR1P46094 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XCR1P46094 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XCR1P46094 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XCR1P46094 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XCR1P46094 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XCR1P46094 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XCR1P46094 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XCR1P46094 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XCR1P46094 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XCR1P46094 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XCR1P46094 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XCR1P46094 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XCR1P46094 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XCR1P46094 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XCR1P46094 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XCR1P46094 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XCR1P46094 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XCR1P46094 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XCR1P46094 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XCR1P46094 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XCR1P46094 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XCR1P46094 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XCR1P46094 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XCR1P46094 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XCR1P46094 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XCR1P46094 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XCR1P46094 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XCR1P46094 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XCR1P46094 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XCR1P46094 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XCR1P46094 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XCR1P46094 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XCR1P46094 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XCR1P46094 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XCR1P46094 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XCR1P46094 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XCR1P46094 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XCR1P46094 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XCR1P46094 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XCR1P46094 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XCR1P46094 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XCR1P46094 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XCR1P46094 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XCR1P46094 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XCR1P46094 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XCR1P46094 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XCR1P46094 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XCR1P46094 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XCR1P46094 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XCR1P46094 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XCR1P46094 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XCR1P46094 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XCR1P46094 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XCR1P46094 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XCR1P46094 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XCR1P46094 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XCR1P46094 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XCR1P46094 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XCR1P46094 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XCR1P46094 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XCR1P46094 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XCR1P46094 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XCR1P46094 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XCR1P46094 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XCR1P46094 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XCR1P46094 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XCR1P46094 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms