Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF4P43489 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF4P43489 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF4P43489 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF4P43489 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF4P43489 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF4P43489 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF4P43489 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF4P43489 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF4P43489 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF4P43489 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF4P43489 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF4P43489 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms