Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSR1P43307 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSR1P43307 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSR1P43307 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSR1P43307 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSR1P43307 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSR1P43307 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSR1P43307 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSR1P43307 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSR1P43307 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSR1P43307 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSR1P43307 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSR1P43307 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSR1P43307 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSR1P43307 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSR1P43307 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSR1P43307 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSR1P43307 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSR1P43307 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSR1P43307 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSR1P43307 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSR1P43307 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSR1P43307 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSR1P43307 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSR1P43307 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSR1P43307 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSR1P43307 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSR1P43307 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSR1P43307 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSR1P43307 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSR1P43307 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSR1P43307 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSR1P43307 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSR1P43307 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSR1P43307 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSR1P43307 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSR1P43307 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSR1P43307 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSR1P43307 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SSR1P43307 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSR1P43307 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SSR1P43307 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SSR1P43307 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSR1P43307 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSR1P43307 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SSR1P43307 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSR1P43307 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SSR1P43307 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSR1P43307 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSR1P43307 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSR1P43307 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSR1P43307 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSR1P43307 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSR1P43307 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSR1P43307 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSR1P43307 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSR1P43307 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSR1P43307 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSR1P43307 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSR1P43307 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSR1P43307 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSR1P43307 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSR1P43307 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SSR1P43307 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSR1P43307 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSR1P43307 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSR1P43307 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSR1P43307 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSR1P43307 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSR1P43307 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSR1P43307 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSR1P43307 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSR1P43307 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSR1P43307 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSR1P43307 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSR1P43307 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSR1P43307 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSR1P43307 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSR1P43307 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSR1P43307 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSR1P43307 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms