Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A2P43004 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC1A2P43004 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A2P43004 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms