Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIA1P42261 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA1P42261 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA1P42261 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA1P42261 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms