Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASIPP42127 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASIPP42127 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASIPP42127 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASIPP42127 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASIPP42127 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASIPP42127 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASIPP42127 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASIPP42127 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASIPP42127 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASIPP42127 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASIPP42127 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASIPP42127 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASIPP42127 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASIPP42127 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASIPP42127 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASIPP42127 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASIPP42127 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASIPP42127 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASIPP42127 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASIPP42127 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASIPP42127 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASIPP42127 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASIPP42127 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASIPP42127 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASIPP42127 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASIPP42127 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASIPP42127 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASIPP42127 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASIPP42127 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASIPP42127 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASIPP42127 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASIPP42127 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASIPP42127 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASIPP42127 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASIPP42127 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASIPP42127 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASIPP42127 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASIPP42127 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ASIPP42127 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASIPP42127 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASIPP42127 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASIPP42127 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASIPP42127 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASIPP42127 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASIPP42127 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASIPP42127 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASIPP42127 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASIPP42127 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASIPP42127 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASIPP42127 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASIPP42127 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASIPP42127 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASIPP42127 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASIPP42127 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASIPP42127 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASIPP42127 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASIPP42127 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASIPP42127 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASIPP42127 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASIPP42127 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASIPP42127 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms