Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX5P35711 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX5P35711 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX5P35711 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX5P35711 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX5P35711 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX5P35711 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX5P35711 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX5P35711 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX5P35711 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX5P35711 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX5P35711 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX5P35711 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX5P35711 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX5P35711 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX5P35711 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX5P35711 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX5P35711 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX5P35711 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX5P35711 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOX5P35711 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOX5P35711 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOX5P35711 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX5P35711 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX5P35711 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX5P35711 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX5P35711 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX5P35711 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX5P35711 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX5P35711 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX5P35711 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX5P35711 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX5P35711 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX5P35711 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX5P35711 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX5P35711 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX5P35711 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX5P35711 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX5P35711 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX5P35711 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX5P35711 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX5P35711 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX5P35711 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX5P35711 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SOX5P35711 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX5P35711 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX5P35711 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX5P35711 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX5P35711 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX5P35711 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX5P35711 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX5P35711 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX5P35711 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX5P35711 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX5P35711 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX5P35711 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX5P35711 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX5P35711 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX5P35711 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX5P35711 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX5P35711 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX5P35711 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX5P35711 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX5P35711 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX5P35711 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX5P35711 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX5P35711 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX5P35711 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX5P35711 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX5P35711 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX5P35711 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX5P35711 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX5P35711 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX5P35711 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX5P35711 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SOX5P35711 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX5P35711 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX5P35711 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX5P35711 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms