Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN1P35523 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN1P35523 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN1P35523 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN1P35523 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN1P35523 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN1P35523 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN1P35523 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN1P35523 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN1P35523 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN1P35523 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN1P35523 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN1P35523 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN1P35523 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLCN1P35523 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN1P35523 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLCN1P35523 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN1P35523 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN1P35523 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.7 ms