Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPDP35247 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SFTPDP35247 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPDP35247 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms