Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCGF2P35227 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF2P35227 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF2P35227 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms