Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TM4SF1P30408 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TM4SF1P30408 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TM4SF1P30408 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TM4SF1P30408 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TM4SF1P30408 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TM4SF1P30408 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TM4SF1P30408 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TM4SF1P30408 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TM4SF1P30408 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TM4SF1P30408 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TM4SF1P30408 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TM4SF1P30408 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 487.1 ms