Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MARCKSP29966 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCKSP29966 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCKSP29966 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCKSP29966 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms