Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA2P29317 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA2P29317 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA2P29317 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms