Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC5P28715 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC5P28715 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC5P28715 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms