Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTAFRP25105 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTAFRP25105 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTAFRP25105 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTAFRP25105 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTAFRP25105 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTAFRP25105 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTAFRP25105 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTAFRP25105 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTAFRP25105 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTAFRP25105 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTAFRP25105 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTAFRP25105 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTAFRP25105 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTAFRP25105 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTAFRP25105 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTAFRP25105 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms