Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP11P24347 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP11P24347 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP11P24347 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP11P24347 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP11P24347 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP11P24347 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP11P24347 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP11P24347 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP11P24347 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP11P24347 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP11P24347 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP11P24347 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP11P24347 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP11P24347 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP11P24347 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP11P24347 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP11P24347 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP11P24347 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP11P24347 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP11P24347 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP11P24347 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP11P24347 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP11P24347 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP11P24347 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP11P24347 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP11P24347 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP11P24347 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP11P24347 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP11P24347 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP11P24347 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP11P24347 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP11P24347 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP11P24347 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP11P24347 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP11P24347 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP11P24347 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP11P24347 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP11P24347 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP11P24347 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP11P24347 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP11P24347 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP11P24347 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP11P24347 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP11P24347 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP11P24347 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP11P24347 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP11P24347 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP11P24347 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP11P24347 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP11P24347 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP11P24347 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP11P24347 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP11P24347 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP11P24347 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP11P24347 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP11P24347 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP11P24347 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP11P24347 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP11P24347 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP11P24347 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP11P24347 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP11P24347 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP11P24347 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP11P24347 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP11P24347 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP11P24347 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP11P24347 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP11P24347 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP11P24347 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP11P24347 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP11P24347 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP11P24347 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP11P24347 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MMP11P24347 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP11P24347 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP11P24347 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP11P24347 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP11P24347 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms