Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SP100P23497 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP100P23497 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SP100P23497 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP100P23497 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP100P23497 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP100P23497 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP100P23497 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP100P23497 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP100P23497 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP100P23497 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SP100P23497 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SP100P23497 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP100P23497 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP100P23497 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP100P23497 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP100P23497 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SP100P23497 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP100P23497 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP100P23497 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP100P23497 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP100P23497 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP100P23497 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP100P23497 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SP100P23497 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP100P23497 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP100P23497 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP100P23497 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP100P23497 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP100P23497 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP100P23497 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP100P23497 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP100P23497 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP100P23497 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP100P23497 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP100P23497 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SP100P23497 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP100P23497 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP100P23497 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP100P23497 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP100P23497 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP100P23497 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP100P23497 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP100P23497 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SP100P23497 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP100P23497 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP100P23497 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP100P23497 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP100P23497 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP100P23497 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP100P23497 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP100P23497 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP100P23497 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP100P23497 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP100P23497 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP100P23497 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP100P23497 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP100P23497 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP100P23497 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP100P23497 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP100P23497 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP100P23497 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP100P23497 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP100P23497 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP100P23497 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP100P23497 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP100P23497 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP100P23497 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP100P23497 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP100P23497 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP100P23497 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP100P23497 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP100P23497 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP100P23497 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP100P23497 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP100P23497 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP100P23497 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP100P23497 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP100P23497 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP100P23497 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP100P23497 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP100P23497 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP100P23497 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP100P23497 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SP100P23497 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP100P23497 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP100P23497 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP100P23497 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP100P23497 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP100P23497 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms