Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1D1P20393 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1D1P20393 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1D1P20393 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms