Protein–RNA interactions for Protein: P20231

TPSB2, Tryptase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPSB2P20231 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPSB2P20231 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TPSB2P20231 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPSB2P20231 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPSB2P20231 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms