Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBPP18428 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBPP18428 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBPP18428 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBPP18428 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBPP18428 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBPP18428 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBPP18428 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBPP18428 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBPP18428 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBPP18428 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBPP18428 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBPP18428 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBPP18428 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBPP18428 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBPP18428 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBPP18428 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBPP18428 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LBPP18428 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBPP18428 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBPP18428 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBPP18428 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LBPP18428 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LBPP18428 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LBPP18428 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LBPP18428 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LBPP18428 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LBPP18428 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBPP18428 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LBPP18428 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LBPP18428 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LBPP18428 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LBPP18428 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LBPP18428 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LBPP18428 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LBPP18428 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LBPP18428 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LBPP18428 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LBPP18428 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LBPP18428 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LBPP18428 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LBPP18428 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LBPP18428 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LBPP18428 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LBPP18428 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LBPP18428 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LBPP18428 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LBPP18428 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LBPP18428 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LBPP18428 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LBPP18428 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LBPP18428 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LBPP18428 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LBPP18428 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LBPP18428 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LBPP18428 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LBPP18428 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LBPP18428 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LBPP18428 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LBPP18428 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LBPP18428 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LBPP18428 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LBPP18428 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LBPP18428 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LBPP18428 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LBPP18428 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LBPP18428 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LBPP18428 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LBPP18428 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LBPP18428 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LBPP18428 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LBPP18428 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LBPP18428 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LBPP18428 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LBPP18428 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LBPP18428 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LBPP18428 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LBPP18428 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LBPP18428 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LBPP18428 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LBPP18428 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LBPP18428 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LBPP18428 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms