Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCAP17252 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCAP17252 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCAP17252 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms