Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2A2P16615 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2A2P16615 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP2A2P16615 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2A2P16615 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms