Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GNB3P16520 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GNB3P16520 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GNB3P16520 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GNB3P16520 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB3P16520 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB3P16520 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB3P16520 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB3P16520 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB3P16520 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB3P16520 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GNB3P16520 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GNB3P16520 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GNB3P16520 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB3P16520 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB3P16520 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB3P16520 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB3P16520 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB3P16520 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB3P16520 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB3P16520 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB3P16520 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GNB3P16520 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB3P16520 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB3P16520 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB3P16520 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB3P16520 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB3P16520 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB3P16520 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB3P16520 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB3P16520 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GNB3P16520 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNB3P16520 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNB3P16520 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNB3P16520 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNB3P16520 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNB3P16520 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GNB3P16520 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GNB3P16520 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNB3P16520 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GNB3P16520 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNB3P16520 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNB3P16520 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNB3P16520 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GNB3P16520 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB3P16520 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB3P16520 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB3P16520 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB3P16520 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB3P16520 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB3P16520 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB3P16520 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GNB3P16520 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB3P16520 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB3P16520 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB3P16520 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB3P16520 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB3P16520 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB3P16520 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB3P16520 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GNB3P16520 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB3P16520 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB3P16520 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB3P16520 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB3P16520 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB3P16520 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GNB3P16520 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GNB3P16520 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GNB3P16520 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GNB3P16520 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB3P16520 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB3P16520 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB3P16520 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB3P16520 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB3P16520 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB3P16520 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GNB3P16520 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms